探索工具
按需要的结果选择工具：获取记录、查看文件、执行计算或连接外部服务。这些能力集成在应用里，但准备条件和验证方式不同。
选择工具大类
| 需要 | 入口 | 准备条件 | 完成后检查 |
|---|---|---|---|
| 读取文件、规划、计算、保存结果 | 内置研究工具 | 可访问项目输入与操作授权 | 工具返回、文件和执行记录 |
| 查询方法依赖的科学软件 | 科学工具目录 | 软件、权重与 Skill 安装分开检查 | 实际可执行程序或导入及版本 |
| 运行 Python、R 或科学任务 | 科学工具 | 所选环境、包或 Compute Host | 代码、错误、结果检查与溯源 |
| 查询生物医学和科学记录 | 科学数据库 | Connector、网络与必要凭据 | 来源 ID、返回字段和截断信息 |
| 查看 CSV、TSV 或表格文件 | 表格与数据集 | 支持的文件和当前输入 | 可见范围、分隔符和完整维度 |
| 查看论文、序列、结构等结果 | 科学查看器 | 支持的格式 | 内容及预览限制 |
| 接入 MCP 服务 | Connectors 与 MCP | 服务器配置和信任 | 连接状态与真实调用 |
| 设置服务身份或密钥 | 服务凭据 | 对应服务的可用账号 | 校验结果或小范围查询 |
| 为本地数据提供自定义工具 | 自定义 MCP | 可运行服务及输入结构 | 发现、成功调用与真实错误行为 |
区分不同可用状态
Listed 表示应用知道该资源，Enabled 表示所选 Agent 可以使用。Connected 证明建立了连接，不保证某个查询参数正确。Executed 表示真实调用返回了结果或错误。Verified 表示对照任务检查了结果。
本地示例采用真实 GSE60450 RNA-seq 计数、只读 QC 服务、阿司匹林结构及公开序列/结构文件，中英文均使用英文应用截图。没有在本机完成的远程 GPU/SSH 和凭据相关操作会明确标出。
提出范围明确的请求
说明来源、操作和预期输出。数据库查询应包括编号类型和小范围条数限制；计算应说明输入、语言和检查要求。工具不可用时要求真实错误，模型凭记忆回答不等于调用成功。
Skill 提供方法，Specialist 提供角色；两者都不会自动安装软件、提供凭据或使不可访问文件变得可读。