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Open-Science

使用 Open-Science 整理研究资料、与代理协作、运行分析并检查保存后的结果。

从这里开始​

  1. 能力与支持的输入:根据文件或研究问题选择路径。
  2. 安装与首次设置:准备应用、代理、模型和运行时。
  3. 第一个项目与结果:创建项目,用一份小表格生成并重新打开说明报告。
  4. 权限与审批:检查操作请求,管理记住的授权。
  5. Notebook 与执行证据:查看代码、变量和产物来源。

跟随真实研究任务​

目标工作流已演示结果
准备阅读集合搭建核心阅读清单文献库中核对的三篇 PRISMA 论文、集合及出版方 PDF
检查并汇总数据从原始数据得到可复现分析GSE60450 基因表达矩阵检查、十二样本质控 CSV、原始计数图和方法报告

Open-Science 中真实的 GSE60450 RNA-seq 图及生成代码

按所需细节查找​

分区内容
Guides页面控件、设置和日常操作
Workflows包含输入、决策、交付物和验收检查的研究场景
Explore tools工具大类、科学服务和接入选择
Skills可复用方法、目录和包管理
Specialists角色、能力分配、委派和审核
Reference精确限制、配置规则、包格式、CLI/API 约定和 Changelog

使用 Search 或 ⌘K / Ctrl+K 搜索当前语言文档的标题、章节和正文。应用自身搜索的范围与文档不同。

运行示例前​

本地示例使用公开 PRISMA 论文和 GSE60450 RNA-seq 矩阵。下载章节中的输入文件,确认任务所需的模型、运行时和权限。

远程计算已包含 Direct SSH RNA-seq 分析、结果回收、重启恢复和取消实操。Slurm 终态监控需要可用的记账查询,GPU 推理需要兼容的软件环境。

技术限制和配置查询见 Reference,版本变化见 Changelog。