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科学查看器

从附件、结果卡或 Files 打开文件,应用按扩展名选择渲染器。预览展示已有内容,不执行科学预测,也不能证明结果正确。

检查真实 PDB 结构

案例演示 查看 1UBQ 结构

本例使用原始 RCSB 1UBQ 泛素结构,可下载 1UBQ.pdb,原生界面显示 660 atoms

  1. 打开 PDB 附件,再进入 Open full screen preview
  2. 切换 Cartoon、Stick、Sphere、Surface、Line 查看不同表示。
  3. 按画布提示拖动旋转、滚动缩放、Shift + 拖动平移。
  4. 按需下载原文件,关闭全屏返回对话。

实际 1UBQ Cartoon 视图

样式重点
Cartoon聚合物骨架/二级结构;缺少合适聚合物原子的文件可能不可用
Stick化学键和局部几何
Sphere以原子为中心的球体
Surface分子表面
Line简化的键线表示

表示方式控件改变绘制效果,保留原坐标。检查缺失残基或预测置信度时,应核对结构文件和对应元数据。

阅读 FASTA

案例演示 阅读 P04637 蛋白序列

打开从 UniProt FASTA 接口下载的 P04637 FASTA,核对 > 标题中的编号、物种、基因及后续序列。原生界面保留源文本,不是序列比对或编辑软件。

实际 UniProt FASTA 源文本预览

要在对话中使用序列,通过 + → Attach files 附加当前文件,并要求 Agent 读取文件,而不是根据文件名推断。本例 P04637 输入可核对 P53_HUMAN 标题、393 个氨基酸和起始序列 MEEPQSDPSV。需要确认文件身份时,再比较返回的校验值与提供的源文件。

模型请求若返回 Managed file or its Session is deleted,在普通消息中重新附加当前文件后重试。仍失败时,保留错误并按故障排查反馈。预览正常不代表模型输入引用仍然有效。

查看小分子

案例演示 从 SMILES 渲染阿司匹林

请求 Molecule Connector 使用 preview_molecule,输入 smiles: "CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O"filename: "aspirin"。打开生成的 aspirin.mol 卡片和全屏。

内置 OpenChemLib 渲染的阿司匹林

本例返回合法结构、C9H8O4、分子量 180.1585213 个重原子,保存了 aspirin.mol,并已人工打开检查。这是离线结构渲染,不预测结合亲和力、对接姿势或药效。

选择科学格式查看器

输入检查内容
PDB已解析原子、可用表示方式与原始坐标
MOL/SDF/SMILES/RXN结构或反应渲染;无效或截断内容可能失败
FASTA 及相关序列文件原始标题、序列标识与范围
H5AD/H5 等分析二进制容器使用兼容分析库;普通文本预览不能解码容器

通用工具栏和 PDF、Office、图像、源文本阅读见预览。数据解释见表格,准确扩展名与范围见文件格式

预览失败

核对原始文件与渲染器的准确错误。结构缺少合适的聚合物原子时可能不提供 Cartoon,切换表示方式不能补回缺失坐标。尝试外部查看器时保留原始字节。预览成功不代表模型能读取附件,也不代表预测程序已安装。