Научные зрители
Откройте файл из вложения, сохраненного результата или файлов. Расширение определяет рендерера. Предварительный просмотр показывает поставляемый контент; Он не дает научного прогноза и не устанавливает, что результат является правильным.
Проверить реальную структуру PDB
Практический пример Проверить структуру 1UBQ
Демонстрация использует оригинальный RCSB 1UBQ структура убиквитина, загруженный как 1UBQ.pdb. В этом примере его нативный предварительный просмотр отображает атомы 660.
- Откройте загруженный PDB, затем выберите Open full screen preview.
- Переключите Cartoon, Stick, Sphere, Surface и Line для проверки различных представлений.
- Перетащите для поворота, прокрутите до зума или Сдвиг + перетаскивание до панорамы, как указано ниже холста.
- Загрузите исходный файл, когда это необходимо. Закройте полный экран, чтобы вернуться к разговору.
| Стиль | Что он подчеркивает |
|---|---|
| Ленточная модель | Представление полимерной магистрали/вторичной структуры. Он может быть недоступен для структуры без подходящих атомов полимера. |
| Фиксировать | Связи и локальная геометрия. |
| Сфера | Атом-центрированные сферы. |
| Поверхность | Молекулярное представление поверхности. |
| Строка | Более легкое представление о связи. |
Представление управляет изменением рендеринга при сохранении координат. Сравните поставляемую структуру и ее метаданные при проверке недостающих остатков или уверенности в прогнозе.
Прочитайте последовательность FASTA
Практический пример Последовательность белка P04637
Открыть P04637 FASTA, скачанный из Конечная точка FASTA от UniProt. Осмотрите присоединение/организм/ген в заголовке > и последовательность ниже него. Нативный рендерер сохраняет исходный текст; Это не приложение для выравнивания последовательности или редактирования.
Чтобы использовать последовательность в разговоре, прикрепите текущий файл к + → Attach files и попросите агента прочитать файл, а не сделать вывод из его имени. Для этого ввода P04637 проверьте заголовок P53_HUMAN, аминокислоты 393 и начальную последовательность MEEPQSDPSV. Сравните отчетную контрольную сумму с файлом, который вы предоставили, когда имеет значение личность.
Если запрос модели возвращает Управляемый файл или его Сеанс удаляется, повторно прикрепите текущий файл в обычном сообщении и повторите. Если он не работает, сохраните ошибку для устранение неполадок. Рабочий предварительный просмотр не гарантирует, что ссылка на ввод модели по-прежнему действительна.
Предварительный просмотр молекулы
Практический пример Аспирин от улыбки
Попросите Molecule Connector запустить preview_molecule с smiles: "CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O" и filename: "aspirin". Откройте созданную карту аспирин.мол и полноэкранный предварительный просмотр.
В этом примере вызов возвращал действительную структуру, формулу C9H8O4, молекулярную массу 180.15852 и Тяжелые атомы 13 и сохранял аспирин.мол. Зритель был вручную открыт и осмотрен. Это офлайн-рендеринг структуры; Он не предсказывает связывающее сродство, стыковочные позы или терапевтическую активность.
Выберите научного рендерера
| Ввод | Что нужно проверить |
|---|---|
| PDB | Парсированные атомы, доступность представления и исходные координаты |
| MOL/SDF/SMILES/RXN | Структура или реакционная рендеринг; Недействительный или усеченный контент может выйти из строя |
| FASTA и связанные с ними файлы последовательностей | Оригинальный заголовок, идентичность последовательности и степень |
| Аналитические двоичные контейнеры, такие как H5AD/H5 | использовать совместимую аналитическую библиотеку; обычный текстовый предварительный просмотр не декодирует контейнер |
Общие элементы управления панели инструментов и PDF, Office, изображения и чтение исходного текста документированы в Превью. Интерпретация данных принадлежит Таблицы; Точные расширения и границы принадлежат Форматы файлов.
Неудачи предварительного просмотра
Проверьте исходный файл и точную ошибку рендерера. Структура без подходящих атомов полимера не может обеспечить обзор карикатуры. Изменение представления не может восстановить недостающие координаты. Сохраняйте оригинальные байты при попытке внешнего зрителя. Успешный предварительный просмотр не устанавливает, что модель может проглотить вложение или что установлена программа прогнозирования.