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科學檢視器

從附件、結果卡或 Files 開啟檔案,應用按副檔名選擇渲染器。預覽展示已有內容,不執行科學預測,也不能證明結果正確。

檢查真實 PDB 結構​

案例演示 檢視 1UBQ 結構

本例使用原始 RCSB 1UBQ 泛素結構,可下載 1UBQ.pdb,原生介面顯示 660 atoms。

  1. 開啟 PDB 附件,再進入 Open full screen preview。
  2. 切換 Cartoon、Stick、Sphere、Surface、Line 檢視不同表示。
  3. 按畫布提示拖動旋轉、滾動縮放、Shift + 拖動平移。
  4. 按需下載原檔案,關閉全屏返回對話。

實際 1UBQ Cartoon 檢視

樣式重點
Cartoon聚合物骨架/二級結構;缺少合適聚合物原子的檔案可能不可用
Stick化學鍵和區域性幾何
Sphere以原子為中心的球體
Surface分子表面
Line簡化的鍵線表示

表示方式控制元件改變繪製效果,保留原座標。檢查缺失殘基或預測置信度時,應核對結構檔案和對應後設資料。

閱讀 FASTA​

案例演示 閱讀 P04637 蛋白序列

開啟從 UniProt FASTA 介面下載的 P04637 FASTA,核對 > 標題中的編號、物種、基因及後續序列。原生介面保留源文字,不是序列比對或編輯軟體。

實際 UniProt FASTA 源文字預覽

要在對話中使用序列,透過 + → Attach files 附加當前檔案,並要求 Agent 讀取檔案,而不是根據檔名推斷。本例 P04637 輸入可核對 P53_HUMAN 標題、393 個氨基酸和起始序列 MEEPQSDPSV。需要確認檔案身份時,再比較返回的校驗值與提供的原始檔。

模型請求若返回 Managed file or its Session is deleted,在普通訊息中重新附加當前檔案後重試。仍失敗時,保留錯誤並按故障排查反饋。預覽正常不代表模型輸入引用仍然有效。

檢視小分子​

案例演示 從 SMILES 渲染阿司匹林

請求 Molecule Connector 使用 preview_molecule,輸入 smiles: "CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O"、filename: "aspirin"。開啟生成的 aspirin.mol 卡片和全屏。

內建 OpenChemLib 渲染的阿司匹林

本例返回合法結構、C9H8O4、分子量 180.15852、13 個重原子,儲存了 aspirin.mol,並已人工開啟檢查。這是離線結構渲染,不預測結合親和力、對接姿勢或藥效。

選擇科學格式檢視器​

輸入檢查內容
PDB已解析原子、可用表示方式與原始座標
MOL/SDF/SMILES/RXN結構或反應渲染;無效或截斷內容可能失敗
FASTA 及相關序列檔案原始標題、序列標識與範圍
H5AD/H5 等分析二進位制容器使用相容分析庫;普通文字預覽不能解碼容器

通用工具欄和 PDF、Office、影象、源文字閱讀見預覽。資料解釋見表格,準確副檔名與範圍見檔案格式。

預覽失敗​

核對原始檔案與渲染器的準確錯誤。結構缺少合適的聚合物原子時可能不提供 Cartoon,切換表示方式不能補回缺失座標。嘗試外部檢視器時保留原始位元組。預覽成功不代表模型能讀取附件,也不代表預測程式已安裝。