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科學檢視器

從附件、結果卡或 Files 開啟檔案,應用按副檔名選擇渲染器。預覽展示已有內容,不執行科學預測,也不能證明結果正確。

檢查真實 PDB 結構

案例演示 檢視 1UBQ 結構

本例使用原始 RCSB 1UBQ 泛素結構,可下載 1UBQ.pdb,原生介面顯示 660 atoms

  1. 開啟 PDB 附件,再進入 Open full screen preview
  2. 切換 Cartoon、Stick、Sphere、Surface、Line 檢視不同表示。
  3. 按畫布提示拖動旋轉、滾動縮放、Shift + 拖動平移。
  4. 按需下載原檔案,關閉全屏返回對話。

實際 1UBQ Cartoon 檢視

樣式重點
Cartoon聚合物骨架/二級結構;缺少合適聚合物原子的檔案可能不可用
Stick化學鍵和區域性幾何
Sphere以原子為中心的球體
Surface分子表面
Line簡化的鍵線表示

表示方式控制元件改變繪製效果,保留原座標。檢查缺失殘基或預測置信度時,應核對結構檔案和對應後設資料。

閱讀 FASTA

案例演示 閱讀 P04637 蛋白序列

開啟從 UniProt FASTA 介面下載的 P04637 FASTA,核對 > 標題中的編號、物種、基因及後續序列。原生介面保留源文字,不是序列比對或編輯軟體。

實際 UniProt FASTA 源文字預覽

要在對話中使用序列,透過 + → Attach files 附加當前檔案,並要求 Agent 讀取檔案,而不是根據檔名推斷。本例 P04637 輸入可核對 P53_HUMAN 標題、393 個氨基酸和起始序列 MEEPQSDPSV。需要確認檔案身份時,再比較返回的校驗值與提供的原始檔。

模型請求若返回 Managed file or its Session is deleted,在普通訊息中重新附加當前檔案後重試。仍失敗時,保留錯誤並按故障排查反饋。預覽正常不代表模型輸入引用仍然有效。

檢視小分子

案例演示 從 SMILES 渲染阿司匹林

請求 Molecule Connector 使用 preview_molecule,輸入 smiles: "CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O"filename: "aspirin"。開啟生成的 aspirin.mol 卡片和全屏。

內建 OpenChemLib 渲染的阿司匹林

本例返回合法結構、C9H8O4、分子量 180.1585213 個重原子,儲存了 aspirin.mol,並已人工開啟檢查。這是離線結構渲染,不預測結合親和力、對接姿勢或藥效。

選擇科學格式檢視器

輸入檢查內容
PDB已解析原子、可用表示方式與原始座標
MOL/SDF/SMILES/RXN結構或反應渲染;無效或截斷內容可能失敗
FASTA 及相關序列檔案原始標題、序列標識與範圍
H5AD/H5 等分析二進位制容器使用相容分析庫;普通文字預覽不能解碼容器

通用工具欄和 PDF、Office、影象、源文字閱讀見預覽。資料解釋見表格,準確副檔名與範圍見檔案格式

預覽失敗

核對原始檔案與渲染器的準確錯誤。結構缺少合適的聚合物原子時可能不提供 Cartoon,切換表示方式不能補回缺失座標。嘗試外部檢視器時保留原始位元組。預覽成功不代表模型能讀取附件,也不代表預測程式已安裝。