Перейти к основному содержимому

Open-Science

Используйте Open-Science для организации источников исследований, работы с агентом, анализа и проверки сохраненных результатов.

Начните здесь

  1. Возможности и вспомогательные материалы: выберите путь для ваших файлов или исследовательских вопросов.
  2. Монтаж и первый раз установка: подготовьте приложение, агент, модель и время выполнения.
  3. Ваш первый проект и результат: откройте небольшую таблицу публичных данных и сохраните проверенное резюме.
  4. Разрешения: проверяйте запрошенные действия и управляйте запоминающимся доступом.
  5. Notebook и доказательства казни: анализ кода, переменных и происхождения результатов.

Выполните реальную исследовательскую задачу

ЦельПрохождениеДемонстрированный результат
Подготовьте сборник для чтенияСоздайте основной список чтенияТри статьи PRISMA, рассмотренные в Библиотеке, коллекция и прикрепленный издатель PDF
Проверить и обобщить набор данныхПревратить необработанные данные в воспроизводимый анализПроверки матрицы экспрессии генов GSE60450, двенадцатиобразцовый QC CSV, фигура и методы подсчета исходного кода

Цифра GSE60450 RNA-seq и код производителя Open-Science

Найдите правильный уровень детализации

РазделПрочитайте его для
РуководстваУправление страницами, настройка и повседневные операции
Исследовательские процессыСценарии исследований с входными данными, решениями, результатами и проверками принятия
Обзор инструментовСемьи инструментов, научные услуги и варианты интеграции
SkillsМногоразовые методы, каталог и управление пакетами
СпециалистыРоли, назначенные возможности, делегирование полномочий и обзор
ReferenceТочные ограничения, правила конфигурации, форматы пакетов, контракты CLI/API и Changelog

Используйте Search или <unk>K / Ctrl+K для поиска заголовков, заголовков и текста. Собственный поиск приложения имеет другой объем.

Перед тем, как привести пример

Местные переходы используют общедоступные документы PRISMA и матрицу GSE60450 RNA-seq. Загрузите связанные входы и подтвердите модель, время выполнения и разрешения, необходимые для каждой задачи.

Дистанционные вычисления включает в себя завершенный анализ Direct SSH RNA-seq, сбор выходных данных, восстановление и отмену перезапуска. Мониторинг терминалов Slurm требует бухгалтерского учета; Для вывода GPU необходима совместимая программная среда.

Используйте Справочник для технических ограничений и конфигурации и Изменить для истории выпуска.