Vérificateurs scientifiques
Ouvrir un fichier à partir d'une pièce jointe, d'un résultat enregistré ou de Fichiers. L'extension détermine le rendu. Un aperçu montre le contenu fourni; il n'exécute pas de prédiction scientifique ou n'établit pas que le résultat est correct.
Inspecter une véritable structure de l'APB
Exemple pratique Inspecter la structure du 1UBQ
La démonstration utilise la Structure du RCSB 1UBQ ubiquitine originale, téléchargée sous la forme de 1UBQ.pdb. Dans cet exemple, son aperçu natif a affiché atomes de 660.
- Ouvrez le PDB téléchargé, puis sélectionnez Open full screen preview.
- Interruptez Cartoon, Stick, Sphere, Surface et Line pour inspecter différentes représentations.
- Faites glisser pour tourner, faites défiler pour zoomer, ou Maj + traînée pour lancer, comme indiqué sous la toile.
- Téléchargez le fichier original au besoin. Fermez l'écran complet pour revenir à la conversation.
| Style | Ce qu'il souligne |
|---|---|
| Ruban | Représentation de l'épine dorsale et de la structure secondaire des polymères. Il peut ne pas être disponible pour une structure sans atomes de polymères appropriés. |
| Bâton | Obligations et géométrie locale. |
| Sphère | Des sphères centrées sur l'atome. |
| Surface | Représentation moléculaire de la surface. |
| Ligne | Une représentation d'obligations plus légère. |
La représentation contrôle le rendu des changements tout en préservant les coordonnées. Comparer la structure fournie et ses métadonnées lors de la vérification des résidus manquants ou de la confiance dans les prévisions.
Lire une séquence FASTA
Exemple pratique Lire la séquence de protéines P04637
Ouvrez P04637 FASTA, téléchargé depuis Le paramètre FASTA d'UniProt. Inspectez l'adhésion/organisme/genre dans l'en-tête > et la séquence ci-dessous. Le rendu natif conserve le texte source; il ne s'agit pas d'une application d'alignement ou d'édition de séquences.
Pour utiliser la séquence dans une conversation, joignez le fichier actuel avec + → Attach files et demandez à l'agent de lire le fichier plutôt que de déduire de son nom. Pour cette entrée P04637, vérifiez l'en-tête P53_HUMAN, Acides aminés 393 et la séquence initiale MEEPQSDPSV. Comparez la somme de contrôle déclarée avec le fichier que vous avez fourni lorsque l'identité compte.
Si une requête modèle renvoie Le fichier géré ou sa session est supprimé, rebranchez le fichier courant dans un message normal et réessayez. Si elle persiste, conservez l'erreur pour Dépannage. Un aperçu de travail ne garantit pas la validité de la référence model-input.
Aperçu d'une molécule
Exemple pratique Aspirine sensible de SMILES
Demandez au Molecule Connector d'exécuter preview_molecule avec smiles: "CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O" et filename: "aspirin". Ouvrez la carte aspirine.mol générée et l'aperçu plein écran.
Dans cet exemple, l'appel a retourné une structure valide, la formule C9H8O4, le poids moléculaire 180.15852 et 13 atomes lourds, et a enregistré aspirine.mol. Le spectateur a été ouvert et inspecté manuellement. c'est le rendu de structure hors ligne; il ne prédit pas l'affinité de liaison, les poses d'amarrage ou l'activité thérapeutique.
Choisir un rendu scientifique
| Entrée | Quoi inspecter? |
|---|---|
| APB | atomes parsés, disponibilité de la représentation et coordonnées originales |
| MOL/SDF/SMILES/RXN | la structure ou le rendu des réactions; un contenu invalide ou tronqué peut échouer |
| FASTA et les fichiers de séquences connexes | En-tête original, identité de la séquence et étendue |
| Contenants binaires analytiques tels que H5AD/H5 | Utiliser une bibliothèque d'analyse compatible; l'aperçu du texte ordinaire ne décode pas le conteneur |
Les contrôles partagés de la barre d'outils et la lecture de PDF, Office, image et texte source sont documentés dans Aperçus. L'interprétation des données appartient à Tableaux; les extensions et limites exactes appartiennent à Formats de fichiers.
Erreurs d'aperçu
Vérifiez le fichier original et l'erreur exacte du rendeur. Une structure sans atomes de polymères appropriés ne peut offrir une vue cartoon; changement de représentation ne peut pas restaurer les coordonnées manquantes. Gardez les octets originaux lors de l'essai d'un visionneur externe. Un aperçu réussi n'établit pas qu'un modèle peut ingérer la pièce jointe, ou qu'un programme de prédiction est installé.