Перейти к основному содержимому

Извлеките таблицу литературных доказательств

Практический пример Десять испытаний масок и респираторных инфекций

Этот рабочий процесс начинается с определенного набора из десяти документов и заканчивается таблицей доказательств, связанной с источником, и примечанием о неопределенности. Он демонстрирует извлечение для обзора литературы общественного здравоохранения. Поставляемый набор представляет собой обучающий выбор, а не комплексный поиск или завершенный систематический обзор.

Подготовьте ограниченный набор источников​

Скачать десятибумажный список источников. Он включает в себя DOI, PMCID и оригинальные полнотекстовые ссылки для исследований в сообществах, домашних хозяйствах и здравоохранении. Получать и читать источники в соответствии с их заявленными условиями доступа.

Для того же ввода текста, используемого в этом примере, загрузите Сценарий источника и запустите его с помощью Python 3 в локальной рабочей папке:

python3 prepare-mask-sources.py

Скрипт загружает эти десять европейских записей PMC XML, сохраняет идентификатор источника, заголовки разделов и таблицы и создает mask-trials-fulltext.md. Он сообщает о неудаче, вместо того, чтобы молча пропустить исследование. Оригинальные полные тексты не перераспределяются с Вики. Если загрузка не удалась, получите эту бумагу через ее исходную ссылку, прежде чем рассматривать набор как завершенный.

В проекте Open-Science выберите рабочую модель и прикрепите полученный файл Markdown к + → Attach files. Проверьте, что список источников содержит десять различных исследований. текстовая версия помогает в извлечении; вернуться к исходной статье для макета, фигур или двусмысленной структуры таблицы.

Нажмите на вложение, чтобы открыть его предварительный просмотр. Каждое исследование начинается с заголовка, DOI и исходной ссылки, за которой следуют текст раздела и таблицы. Сопоставьте эти десять идентичностей со списком источников. Не учитывайте повторяющиеся заголовки разделов в качестве дополнительных исследований.

Фактически прикрепленный полнотекстовый пакет сохраняет идентификатор источника и разделы статей.

Попросите один ряд за испытание​

Build an English evidence-extraction table for the ten randomized
trials on masks and respiratory infections in the attached source pack.
Read each study's methods, results and relevant tables.
Save mask-trials-evidence.csv with one row per trial: DOI, year,
setting, randomization unit, sample size, intervention, comparator,
primary outcome, reported main estimate with uncertainty, analysis
population, important limitation, and source section/table locator.
Preserve cluster design, adherence and intention-to-treat distinctions.
Do not substitute a subgroup or per-protocol result for the main result.
Save mask-trials-reading-notes.md explaining differences and missing evidence.
Do not pool these heterogeneous trials or give clinical recommendations.
Use only the supplied sources, write in English and do not delegate.

Разрешить предполагаемые запросы на чтение источника. Убедитесь, что агент достигает всех десяти разделов исследования, а не использует только первый реферат или предполагает, что похожие статьи являются дубликатами.

Обзор извлеченных доказательств​

Откройте CSV после завершения ответа. Сравните десять значений DOI со списком источников, а затем проверьте представленную оценку и анализ населения по каждому разделу или таблице результатов.

Таблица десяти судебных доказательств в Open-Science

Обратите особое внимание на эти различия:

  • Единица рандомизации: - деревня, дом, палатка или больничная палата не являются индивидуально рандомизированными участниками.
  • Симптоматическая серопревалентность Итог:, лабораторно подтвержденная инфекция и гриппоподобное заболевание являются различными конечными точками.
  • Анализ: - результат подгруппы, основанный на присоединении или раннем вмешательстве, должен оставаться отдельным от основного рандомизированного сравнения.
  • Неопределенность: сохраняйте доверительные интервалы и неопределённые результаты. Статистически незначимая оценка не доказывает отсутствие эффекта.

Используйте Примерная таблица доказательств и синтез-нота для проверки формата. Это исходные материалы для обзора; Научная интерпретация по-прежнему зависит от исходных источников, качества исследования и вопроса, на который вы намерены ответить.

Открыть mask-trials-reading-notes.md и CSV. В финальной таблице этой серии есть 10 строки · 12 столбцы. Расширить предварительный просмотр или загрузить файл для чтения длинных ячеек; Усеченные ячейки не лишены исходного текста. Примечания сохраняют десять идентичностей исследования и объясняют, почему их результаты и популяции не должны объединяться автоматически.

Сохраненные заметки для чтения и завершенный десятирядный выпуск

Когда строка неверна или неполна, назовите исследование и точный раздел / таблицу источника, запросите пересмотр файлов оба, а затем снова откройте их. Например, держите рандомизированный семейный поток Cowling 2008 отдельно от его анализируемого подмножества. Обновление прозаического ответа само по себе не обновляет сохраненную таблицу.

Продолжить обзор​

Сохранить рассмотренную таблицу с ее источниками и решениями о добыче. Формальный обзор также нуждается в документальном поиске, критериях приемлемости, скрининге, дублировании извлечения и соответствующей оценке предвзятости. См. Основной рабочий процесс списков чтения для проверки источника и проверка претензий, когда заключение требует более тщательной проверки.

Последнее обновление