Open-Science
Utilisez Open-Science pour organiser des sources de recherche, travailler avec un agent, effectuer des analyses et inspecter les résultats enregistrés.
Commencez ici.
- Capacités et intrants pris en charge : choisissez un chemin pour vos fichiers ou vos questions de recherche.
- Installation et première configuration : préparez l'application, l'agent, le modèle et l'exécution.
- Votre premier projet et résultat : ouvrez une petite table de données publique et enregistrez un résumé vérifié.
- Autorisations: Inspecter les actions demandées et gérer l'accès mémorisé.
- Notebook et preuves d'exécution: examiner le code, les variables et la provenance des résultats.
Suivre une véritable tâche de recherche
| Objectif | Passage à pied | Résultat démontré |
|---|---|---|
| Préparer une collection de lecture | Construisez une liste de lecture de base | Trois articles de PRISMA examinés dans la bibliothèque, une collection et un éditeur joint PDF |
| Vérifier et résumer un ensemble de données | Transformer les données brutes en une analyse reproductible | Vérification de la matrice d'expression des gènes GSE60450, rapport de douze échantillons QC CSV, chiffre de nombre brut et méthodes |
Trouvez le bon niveau de détail
| Chapitre | Lisez-le pour |
|---|---|
| Guides | Contrôles de page, configuration et opérations quotidiennes |
| Parcours de recherche | Scénarios de recherche comportant des intrants, des décisions, des produits livrables et des vérifications d'acceptation |
| Explorer les outils | Familles d'outils, services scientifiques et choix d'intégration |
| Skills | Méthodes réutilisables, le répertoire et la gestion des paquets |
| Spécialistes | Rôles, capacités assignées, délégation et examen |
| Reference | Limites exactes, règles de configuration, formats de paquets, contrats CLI/API et Changelog |
Utilisez Search ou Ctrl+K pour rechercher les titres, les titres et le texte du corps de cette documentation. La recherche de l'application a une portée différente.
Avant de lancer un exemple
Les parcours locaux utilisent les papiers publics PRISMA et la matrice GSE60450 RNA-seq. Téléchargez les entrées liées et confirmez le modèle, l'exécution et les permissions nécessaires à chaque tâche.
Calcul à distance comprend une analyse Direct SSH RNA-seq, une collecte de sortie, une récupération de redémarrage et une annulation. La surveillance des terminaux Slurm nécessite une comptabilité opérationnelle; L'inférence GPU a besoin d'un environnement logiciel compatible.
Utilisez Référence pour les limites techniques et la configuration, et Changer de journal pour l'historique des versions.