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示例数据与预期结果

使用这些公开文件复现文档示例。来源说明、原始文件校验值和样本 QC 基准统一保存在本页,各功能章节仅引用其所需输入和验收标准。

来源和输入约定

GEO 系列记录提供原始 GSE60450_Lactation-GenewiseCounts.txt.gz已发表 RNA-seq 分析流程提供该数据的方法背景。本例止于分析前检查,不复现论文全部分析。

属性实际核对值
解压文件GSE60450_Lactation-GenewiseCounts.txt
大小1,340,161 字节
基因行27,179
EntrezGeneID、Length、12 个样本计数列
SHA-256128d2411f3169de0cac9963c30152bb5c9a3083ac80fd25651b97cf4b7304691
重复 ID / 缺失计数 / 无效计数0 / 0 / 0

下载保持原样的解压输入原压缩文件。Omics Archives 元数据工具可返回补充文件链接,不自动下载矩阵。下载后通过 Attach files 上传。

样本 QC 基准

样本原始总计数零计数基因检出基因检出计数中位数
MCL1-DG23,227,641866418515237
MCL1-DH21,777,891879218387223
MCL1-DI24,100,765864618533213
MCL1-DJ22,665,371870618473194
MCL1-DK21,529,331908218097188
MCL1-DL20,015,386916918010190.0
MCL1-LA20,392,113924717932257.0
MCL1-LB21,708,152882818351252
MCL1-LC22,241,607980317376191.0
MCL1-LD21,988,240990417275176
MCL1-LE24,723,8271047816701138
MCL1-LF24,657,2931043416745135

短标签与完整样本标识的映射保存在 CSV 中。四项数值指标已针对该输入独立核对;它们属于原始计数的描述性检查,不构成后续统计设计的验证。

已保存的示例输出

下载内容
质控 CSV十二行、原列名映射和四项指标
图表样本原始计数总量
方法报告应用保存的独立复核说明
Notebook ZIP未改动的原生导出

选择其他示例

任务输入或参考操作说明
保存第一个结果上方十二行 QC CSV首次项目
复算完整矩阵上方原始基因计数矩阵数据质量工作流
整理文献集合含出版社链接的PRISMA 阅读清单核心阅读清单
小型逆折叠计算人泛素 1UBQ科学工具

方法报告和 Notebook 保留了原计算的路径及证据范围。在应用外重跑前,先准备自己的输入位置和依赖。