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你的第一个项目与结果

案例演示 阅读样本 QC 表并保存说明

先打开一张小表格,再保存一份说明。本路线使用真实公开基因表达数据计算得到的十二行样本 QC 表,不需要重新分析完整矩阵,也不需要安装绘图库。

准备模型和示例文件

  1. 完成首次设置,确认模型连接可用。
  2. 示例数据下载样本 QC CSV
  3. 保留下载文件不变。这是一张派生汇总表;原始矩阵与计算方法在同一示例页说明。

打开并总结表格需要可用的 Agent 和模型。只有要求重新计算指标时才需要 Python 或 R;相应步骤见完整数据质量工作流

创建项目

在首页选择 New projectName 填写 Gene-count QC reviewDescription 填写 Review the public sample-QC table and record its interpretation.Agent Context 填写 Preserve the source file. Explain descriptive counts without inferring differential expression.,然后选择 Create project

确认会话列表上方出现项目名称。这些名称只是示例,你可以改成便于查找自己研究的名称。字段修改和源文件夹设置见项目

附加并检查表格

  1. 新建会话,选择 + → Attach files,选中下载的 CSV。
  2. 等待附件标签出现,然后打开预览。
  3. 确认有十二行样本。检查完整样本标识,以及总计数、零计数基因数、检出基因数和正计数中位数等列。
  4. 关闭预览返回输入框,保留请求中的附件。

在应用中打开样本 QC 表

若预览为空或列没有分开,请确认附加的是 CSV,而非下载失败后保存的网页。分隔符与预览控件见表格

请求保存说明

确认模型后发送:

读取附加的样本 QC CSV,保存一份简短 Markdown 说明,文件名为
sample-qc-overview.md。分为“表格内容”“指标含义”“下一步检查”三节。
指出样本标识列,并结合附加数据解释各项 QC 指标。保持原文件不变。
不要重新计算基因矩阵、安装软件包或推断差异表达。注明这是一份派生的
描述性汇总。如果无法读取文件,请报告错误,不要猜测内容。
保存后提供报告链接。

出现审批时,确认操作针对附加输入和指定输出,再批准所需操作;无关请求可以拒绝。等待审批需要你回应;工具调用失败则需要处理错误。输入框与任务状态说明了这些状态的区别。

检查并保留结果

  1. 在回答或项目 Files 面板中选择 sample-qc-overview.md
  2. 确认包含指定的三节,且列含义与 CSV 一致。特别注意:检出基因指计数大于零,正计数中位数不包含零计数。
  3. 确认报告说明的是汇总表,没有宣称得到了新的生物学发现。
  4. 如需外部副本,下载报告。重命名并置顶会话,便于返回。

保存的报告能够打开,且内容与附加表格一致,即完成本次任务。如果回答只有文字而没有文件,请要求 Agent 将文字保存为指定 Markdown 文件,再打开检查。读取或保存报错时,保留错误信息并按故障排查处理。

继续分析原始数据

若要复算表格并生成图表,请进入将原始数据变成可复现分析。该路线补充原始矩阵、Python 依赖、准确的输出列规范和数值检查。代码与文件证据的查看方式见 Notebook