示例資料與預期結果

使用這些公開檔案復現文件示例。來源說明、原始檔案校驗值和樣本 QC 基準統一儲存在本頁，各功能章節僅引用其所需輸入和驗收標準。

來源和輸入約定

GEO 系列記錄提供原始 GSE60450_Lactation-GenewiseCounts.txt.gz；已發表 RNA-seq 分析流程提供該資料的方法背景。本例止於分析前檢查，不復現論文全部分析。

屬性	實際核對值
解壓檔案	GSE60450_Lactation-GenewiseCounts.txt
大小	1,340,161 位元組
基因行	27,179
列	EntrezGeneID、Length、12 個樣本計數列
SHA-256	128d2411f3169de0cac9963c30152bb5c9a3083ac80fd25651b97cf4b7304691
重複 ID / 缺失計數 / 無效計數	0 / 0 / 0

下載保持原樣的解壓輸入或原壓縮檔案。Omics Archives 後設資料工具可返回補充檔案連結，不自動下載矩陣。下載後透過 Attach files 上傳。

樣本 QC 基準

樣本	原始總計數	零計數基因	檢出基因	檢出計數中位數
MCL1-DG	23,227,641	8664	18515	237
MCL1-DH	21,777,891	8792	18387	223
MCL1-DI	24,100,765	8646	18533	213
MCL1-DJ	22,665,371	8706	18473	194
MCL1-DK	21,529,331	9082	18097	188
MCL1-DL	20,015,386	9169	18010	190.0
MCL1-LA	20,392,113	9247	17932	257.0
MCL1-LB	21,708,152	8828	18351	252
MCL1-LC	22,241,607	9803	17376	191.0
MCL1-LD	21,988,240	9904	17275	176
MCL1-LE	24,723,827	10478	16701	138
MCL1-LF	24,657,293	10434	16745	135

短標籤與完整樣本標識的對映儲存在 CSV 中。四項數值指標已針對該輸入獨立核對；它們屬於原始計數的描述性檢查，不構成後續統計設計的驗證。

已儲存的示例輸出

下載	內容
質控 CSV	十二行、原列名對映和四項指標
圖表	樣本原始計數總量
方法報告	應用儲存的獨立複核說明
Notebook ZIP	未改動的原生匯出

選擇其他示例

任務	輸入或參考	操作說明
儲存第一個結果	上方十二行 QC CSV	首次專案
復算完整矩陣	上方原始基因計數矩陣	資料質量工作流
整理文獻集合	含出版社連結的PRISMA 閱讀清單	核心閱讀清單
小型逆折疊計算	人泛素 1UBQ	科學工具

方法報告和 Notebook 保留了原計算的路徑及證據範圍。在應用外重跑前，先準備自己的輸入位置和依賴。