打开与预览文件
打开保存结果，检查所选版本。本页说明通用查看控件与普通文档格式。数据解释见表格，序列与结构专用控件见科学查看器。
打开、放大和返回
点击生成文件卡片打开预览。Open … in split view beside the session 将文件放在对话旁。切换标签查看其他文件，Open full screen preview of … 放大单个文件，Close preview of … 关闭相应视图。Collapse preview panel 隐藏面板，不删除文件。文件预览全屏与 Files 文件库全屏是不同视图。
| 标题栏控件 | 含义 |
|---|---|
| 文件名与版本 | 下载或引用前确认目标 |
| Download | 保存该结果的副本 |
| File actions → Provenance | 查看托管产物版本的证据 |
| View in context | 返回产出会话 |
| Previous / Next file version | 切换已有不可变版本 |
| Edit / Compare | 仅适用于支持的托管内容，见文件 |
| Close | 关闭视图，不是删除 |
上述关闭行为适用于文件预览。Side Chat 标签 的关闭需要另行确认，因为确认后会停止并删除该旁聊。
想为自己保存阅读位置时，选中文字或 PDF 区域后选择 For me，参阅阅读书签。
按格式阅读文件
阅读结果表
案例演示 阅读 RNA-seq 质控表、图表与报告
打开 rnaseq-sample-qc.csv，本例显示 12 rows · 6 columns，首行作为表头。横向滚动可查看较长的原始列名及右侧指标。行号是显示位置，不是基因或样本编号。
检查列名与完整标识是否可读。字段解释与公共基准核对见表格与数据集。
原 .txt 是制表符分隔矩阵，可能以文本而非 CSV 网格显示。改扩展名不会自动改变分隔符或数据含义。大文件预览可能受限，应阅读显示的行列限制，不能把可见部分当作全部数据。格式限制见参考。
检查图表
打开 rnaseq-library-sizes.png，使用 Zoom in / Zoom out / Reset zoom。标签太小时打开全屏。缩放只改变显示，不重新取样，也不更新统计结果。
核对原始计数坐标轴、十二个样本标签以及 CSV/报告中的名称对应。柱高不同不能单独证明差异表达。本例只做分析前的描述性检查，没有归一化或假设检验。
结合方法与溯源阅读
Markdown 渲染标题、列表、代码和链接。接受图表前检查校验和及方法。链接通过相应来源预览或外部浏览器打开，先核对完整域名。加载失败不等于已阅读来源。
通过 Provenance 检查所选产物的代码、执行日志、消息、环境及审查。出现 partial / bounded / No review for this version 时，按 Notebook 与执行证据理解其范围。
阅读 Office 文件与多页图像
案例演示 查看质控结果的 Office 与 TIFF 阅读副本
Word 报告、Excel 工作簿、PowerPoint 幻灯片和双页 TIFF整理了同一份 GSE60450 QC 结果，属于阅读副本，不是新的分析。
| 格式 | 操作与检查重点 |
|---|---|
| DOCX | 附加并打开报告，滚动阅读两页，检查首个样本的数值及方法与解释。全屏预览能容纳较长行；这里没有 Word 编辑工具栏 |
| XLSX | 打开工作簿，在底部选择 Summary 或 Samples。横向滚动查看最后一列。Samples 有 12 行样本，加上表头、间隔和来源说明共 17 个已用行；预览显示 17 行不表示有 17 个生物样本。已保存的单元格数值也不证明重新计算过公式 |
| PPTX | 从 QC 摘要向下滚动到 Methods and interpretation。两页幻灯片均已在本地渲染；此处是阅读视图，不是编辑器或放映控制台 |
| TIFF | 用 Next page / Previous page 切换。两页分别显示原始文库大小和有计数基因的中位数。Zoom in / Zoom out / Reset zoom 只改变视图；解释图像前确认 Page 1 of 2 或 Page 2 of 2 |
| JSON | 打开摘要文件检查源码、标识符和数值。它以代码显示，不是可展开的对象树 |
| HTML | 打开阅读表格，Source 查看 HTML，Render 返回排版视图，两者都不会重跑 QC |
出现 Preview unavailable → Open this Office file in your default app to view it. 时，本地文件可使用 Open，托管上传文件可使用 Download，再通过兼容应用打开。内置预览无法显示时，仍可用这条路径查看原文件。
其他受支持的预览
下表列出各类文件可用的预览方式与控制入口。
| 类型 | 检查重点 | 控件与边界 |
|---|---|---|
| 页码、可读文字、源文件 | 缩略图、目录、文档搜索、翻页、缩放、文字/区域选择；扫描页可能没有可搜索文字 | |
| 代码/文本 | 所需代码块是否完整、语言 | 行号、语法显示、复制/下载；超大内容可能受限 |
| JSON / HTML | 结构或渲染内容 | 渲染不代表允许以应用权限执行代码 |
| 图像 / TIFF | 分辨率与目标图 | 缩放/平移；TIFF 使用专用渲染流程 |
| Office | 托管渲染是否成功 | DOCX/XLSX/PPTX 不可预览时下载后外部打开；不等于完整 Office 编辑 |
| 生物序列 | 序列身份和范围 | 支持的 FASTA 使用序列视图 |
| 分子结构 | 解析模型和表现方式 | 旋转、缩放、平移及支持的 Cartoon/Stick/Sphere/Surface/Line；缺少结构信息可能禁用某种表现 |
| 未知格式 | 文件名、大小、回退提示 | 下载到合适软件查看；扩展名不证明内容有效 |
PDF 上下文只关联当前任务需要的论文，后续不应使用时取消关联。每会话最多关联三份 PDF。没有附全文的文献条目提供元数据，不代表模型已阅读全文，见文献库。
图表源码与不同格式的控件
对话中的 Mermaid 图渲染完成后，可在操作栏点击 View source 查看图表原文，View diagram 返回图形。渲染前不提供此切换；图表被错误面板替代时，切换不可用。切换仅改变显示，不修改分析或源文件。
示例 切换 Mermaid 图表与源码
在新会话请求：显示一个 Mermaid 流程图，包含三个步骤：附加文件 → 检查预览 → 保存报告，不要加入文件链接。 渲染完成后，将指针移到图上，选择 View source，核对三个节点。选择 View diagram 返回；标签过小时使用 View fullscreen。
流程图展示请求中的步骤。检查已保存文件时，请打开实际文件卡片；流程图节点本身不是产物引用。
| 格式 | 应检查的行为 |
|---|---|
| 单页 PDF | 不显示多页 Reading 入口，使用普通 PDF 预览控件 |
| CSV | 检查显示范围，有限预览不能当作完整输入或导出 |
| Office 工作簿 | 检查所选可见工作表及渲染错误，不支持的编辑使用原文件 |
| TIFF | 先检查选中页和渲染结果，再解释像素或样本值 |
| JSON | 格式重要时核对保留的源文本 |
| Markdown 表格 | 聚焦表格操作，使用键盘访问复制、下载和全屏控件 |
提取 PDF 图片与表格
需要从文献 PDF 取得图片或可复用表格时，使用此功能。先在文献库添加并检查 PDF；只有文献元数据不能作为提取输入。
- 打开 PDF 预览，选择 Original PDF 旁的 Figures and tables。
- 首次使用时选择 Download and continue，安装所需模型资源，并等待安装和完整性检查。资源就绪后使用 Analyze PDF。
- 查看逐页进度。完成后选择候选图表，用 Show in PDF 对照原文页面、图注及周围文字。
- 图片可在图像预览中使用 Copy image 或 Download image。表格选择 Table，再选择 TSV、HTML 或 Markdown，使用对应复制/下载操作；需要检查原始裁图时选择 Image。
- 重新打开导出文件，检查行列对应、合并表头、单位、脚注和跨页内容，再用于分析或报告。
模型资源下载后，提取在本地运行。重新打开同一 PDF 可以复用缓存结果；需要重新提取时使用 Analyze again。需要停止时使用进度中的取消控件。分析未完成时，先检查失败页提示，不要把当前可见候选项当作整篇文档的全部图表。
Unplaced table text 和 Table notes 保留需要人工核对的内容。结构化单元格不可用时，对照原始裁图和 PDF，不要推测缺失单元格。此提取流程暂不支持扫描页和旋转页；提取不可用不等于 PDF 本身不能阅读。
让 Agent 读取已提取的图表
- 打开目标 PDF，使用 Read with agent 将它链接到当前会话，并在 Figures and tables 完成相关页面的分析。发送问题前，确认输入框中仍有该 PDF 的阅读上下文。只有文献库记录不等于已链接 PDF，链接本身也不会启动这项分析。
- 提问时指明具体的图、表或算法，提供编号或页码，以及要回答的问题。
- 查看工具活动：list_pdf_elements 列出可用的提取元素，read_pdf_element 读取所选证据。要求回答标明来源页码，以及缺失或不确定的内容。
- 对照原图或原表，核对表头、单位和注释。若尚未提取或结果不完整，先分析缺失页面再重试；只有图注不能证明趋势或精确表值。
示例 要求读取已链接论文的表格证据
从已链接 PDF 的提取元素中读取 Table 1，报告物理 PDF 页码、列标题和与我的问题有关的数值。保留单位与脚注，明确说明缺失单元格或提取不完整的地方。
这些工具读取已有提取结果，不会自行启动 PDF 分析。表格可能分批返回，图和算法内容可能以图片提供。需要图片证据时，确认所选模型支持相应输入；图片已送达不等于已正确解读。
主动加载远程媒体
模型回复引用的远程图片、音频和视频，需要你主动加载。操作前阅读控件显示的目标主机。授权只针对当前媒体元素及其地址，不覆盖所有后续回复或整个域名；关闭预览也不能撤回已经发出的请求。
含远程图片的 Mermaid 图可能在加载前被阻止；需要时可要求生成不含嵌入图片的普通图。图片发送给模型时，Open-Science 会移除模型输入副本的附加元数据，原文件保留。这不会移除图片画面中直接可见的敏感内容。
下载后核对原文件
打开目标预览，选择 Download，在系统保存窗口确认文件名和位置，然后保存。重新打开下载副本，检查内容。下载保存的是原文件；TIFF 翻到第二页或 Excel 切换工作表不会把下载限制为当前页或工作表。
预览失败时
先确认保存成功，再核对版本和格式。尝试下载，区分渲染器限制与文件不可用。本地文件在外部修改后，可用 Reload 重新读取。不要为修复显示而覆盖输入。排查时记录文件名、类型、大小、应用版本和报错，不必分享无关私有内容。
实现依据：Mermaid、PDF 条件、CSV、Office、TIFF。
专业格式的入口、控件和文件要求见科学查看器。