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Open-Science

使用 Open-Science 整理研究資料、與代理協作、執行分析並檢查儲存後的結果。

從這裡開始

  1. 能力與支援的輸入:根據檔案或研究問題選擇路徑。
  2. 安裝首次設定:準備應用、代理、模型和執行時。
  3. 第一個專案與結果:建立專案,用一份小表格生成並重新開啟說明報告。
  4. 權限與審批:檢查操作請求,管理記住的授權。
  5. Notebook 與執行證據:檢視程式碼、變數和產物來源。

跟隨真實研究任務

目標工作流已演示結果
準備閱讀集合搭建核心閱讀清單文獻庫中核對的三篇 PRISMA 論文、集合及出版方 PDF
檢查並彙總資料從原始資料得到可復現分析GSE60450 基因表達矩陣檢查、十二樣本質控 CSV、原始計數圖和方法報告

Open-Science 中真實的 GSE60450 RNA-seq 圖及生成程式碼

按所需細節查詢

分割槽內容
Guides頁面控制元件、設定和日常操作
Workflows包含輸入、決策、交付物和驗收檢查的研究場景
Explore tools工具大類、科學服務和接入選擇
Skills可複用方法、目錄和包管理
Specialists角色、能力分配、委派和稽核
Reference精確限制、配置規則、包格式、CLI/API 約定和 Changelog

使用 Search⌘K / Ctrl+K 搜尋當前語言文件的標題、章節和正文。應用自身搜尋的範圍與文件不同。

執行示例前

本地示例使用公開 PRISMA 論文和 GSE60450 RNA-seq 矩陣。下載章節中的輸入檔案,確認任務所需的模型、執行時和權限。

遠端計算已包含 Direct SSH RNA-seq 分析、結果回收、重啟恢復和取消實操。Slurm 終態監控需要可用的記賬查詢,GPU 推理需要相容的軟體環境。

技術限制和配置查詢見 Reference,版本變化見 Changelog