開啟與預覽檔案
開啟儲存結果，檢查所選版本。本頁說明通用檢視控制元件與普通文件格式。資料解釋見表格，序列與結構專用控制元件見科學檢視器。
開啟、放大和返回
點選生成檔案卡片開啟預覽。Open … in split view beside the session 將檔案放在對話旁。切換標籤檢視其他檔案，Open full screen preview of … 放大單個檔案，Close preview of … 關閉相應檢視。Collapse preview panel 隱藏面板，不刪除檔案。檔案預覽全屏與 Files 檔案庫全屏是不同檢視。
| 標題欄控制元件 | 含義 |
|---|---|
| 檔名與版本 | 下載或引用前確認目標 |
| Download | 儲存該結果的副本 |
| File actions → Provenance | 檢視託管產物版本的證據 |
| View in context | 返回產出會話 |
| Previous / Next file version | 切換已有不可變版本 |
| Edit / Compare | 僅適用於支援的託管內容，見檔案 |
| Close | 關閉檢視，不是刪除 |
上述關閉行為適用於檔案預覽。Side Chat 標籤 的關閉需要另行確認，因為確認後會停止並刪除該旁聊。
想為自己儲存閱讀位置時，選中文字或 PDF 區域後選擇 For me，參閱閱讀書籤。
按格式閱讀檔案
閱讀結果表
案例演示 閱讀 RNA-seq 質控表、圖表與報告
開啟 rnaseq-sample-qc.csv，本例顯示 12 rows · 6 columns，首行作為表頭。橫向滾動可檢視較長的原始列名及右側指標。行號是顯示位置，不是基因或樣本編號。
檢查列名與完整標識是否可讀。欄位解釋與公共基準核對見表格與資料集。
原 .txt 是製表符分隔矩陣，可能以文字而非 CSV 網格顯示。改副檔名不會自動改變分隔符或資料含義。大檔案預覽可能受限，應閱讀顯示的行列限制，不能把可見部分當作全部資料。格式限制見參考。
檢查圖表
開啟 rnaseq-library-sizes.png，使用 Zoom in / Zoom out / Reset zoom。標籤太小時開啟全屏。縮放只改變顯示，不重新取樣，也不更新統計結果。
核對原始計數座標軸、十二個樣本標籤以及 CSV/報告中的名稱對應。柱高不同不能單獨證明差異表達。本例只做分析前的描述性檢查，沒有歸一化或假設檢驗。
結合方法與溯源閱讀
Markdown 渲染標題、列表、程式碼和連結。接受圖表前檢查校驗和及方法。連結透過相應來源預覽或外部瀏覽器開啟，先核對完整域名。載入失敗不等於已閱讀來源。
透過 Provenance 檢查所選產物的程式碼、執行日誌、訊息、環境及審查。出現 partial / bounded / No review for this version 時，按 Notebook 與執行證據理解其範圍。
閱讀 Office 檔案與多頁影象
案例演示 檢視質控結果的 Office 與 TIFF 閱讀副本
Word 報告、Excel 工作簿、PowerPoint 幻燈片和雙頁 TIFF整理了同一份 GSE60450 QC 結果，屬於閱讀副本，不是新的分析。
| 格式 | 操作與檢查重點 |
|---|---|
| DOCX | 附加並開啟報告，滾動閱讀兩頁，檢查首個樣本的數值及方法與解釋。全屏預覽能容納較長行；這裡沒有 Word 編輯工具欄 |
| XLSX | 開啟工作簿，在底部選擇 Summary 或 Samples。橫向滾動檢視最後一列。Samples 有 12 行樣本，加上表頭、間隔和來源說明共 17 個已用行；預覽顯示 17 行不表示有 17 個生物樣本。已儲存的單元格數值也不證明重新計算過公式 |
| PPTX | 從 QC 摘要向下滾動到 Methods and interpretation。兩頁幻燈片均已在本地渲染；此處是閱讀檢視，不是編輯器或放映控制檯 |
| TIFF | 用 Next page / Previous page 切換。兩頁分別顯示原始文庫大小和有計數基因的中位數。Zoom in / Zoom out / Reset zoom 只改變檢視；解釋影象前確認 Page 1 of 2 或 Page 2 of 2 |
| JSON | 開啟摘要檔案檢查原始碼、識別符號和數值。它以程式碼顯示，不是可展開的物件樹 |
| HTML | 開啟閱讀表格，Source 檢視 HTML，Render 返回排版檢視，兩者都不會重跑 QC |
出現 Preview unavailable → Open this Office file in your default app to view it. 時，本地檔案可使用 Open，託管上傳檔案可使用 Download，再透過相容應用開啟。內建預覽無法顯示時，仍可用這條路徑檢視原檔案。
其他受支援的預覽
下表列出各類檔案可用的預覽方式與控制入口。
| 型別 | 檢查重點 | 控制元件與邊界 |
|---|---|---|
| 頁碼、可讀文字、原始檔 | 縮圖、目錄、文件搜尋、翻頁、縮放、文字/區域選擇；掃描頁可能沒有可搜尋文字 | |
| 程式碼/文字 | 所需程式碼塊是否完整、語言 | 行號、語法顯示、複製/下載；超大內容可能受限 |
| JSON / HTML | 結構或渲染內容 | 渲染不代表允許以應用權限執行程式碼 |
| 影象 / TIFF | 解析度與目標圖 | 縮放/平移；TIFF 使用專用渲染流程 |
| Office | 託管渲染是否成功 | DOCX/XLSX/PPTX 不可預覽時下載後外部開啟；不等於完整 Office 編輯 |
| 生物序列 | 序列身份和範圍 | 支援的 FASTA 使用序列檢視 |
| 分子結構 | 解析模型和表現方式 | 旋轉、縮放、平移及支援的 Cartoon/Stick/Sphere/Surface/Line；缺少結構資訊可能禁用某種表現 |
| 未知格式 | 檔名、大小、回退提示 | 下載到合適軟體檢視；副檔名不證明內容有效 |
PDF 上下文只關聯當前任務需要的論文，後續不應使用時取消關聯。每會話最多關聯三份 PDF。沒有附全文的文獻條目提供後設資料，不代表模型已閱讀全文，見文獻庫。
圖表原始碼與不同格式的控制元件
對話中的 Mermaid 圖渲染完成後，可在操作欄點選 View source 檢視圖表原文，View diagram 返回圖形。渲染前不提供此切換；圖表被錯誤面板替代時，切換不可用。切換僅改變顯示，不修改分析或原始檔。
示例 切換 Mermaid 圖表與原始碼
在新會話請求：显示一个 Mermaid 流程图，包含三个步骤：附加文件 → 检查预览 → 保存报告，不要加入文件链接。 渲染完成後，將指標移到圖上，選擇 View source，核對三個節點。選擇 View diagram 返回；標籤過小時使用 View fullscreen。
流程圖展示請求中的步驟。檢查已儲存檔案時，請開啟實際檔案卡片；流程圖節點本身不是產物引用。
| 格式 | 應檢查的行為 |
|---|---|
| 單頁 PDF | 不顯示多頁 Reading 入口，使用普通 PDF 預覽控制元件 |
| CSV | 檢查顯示範圍，有限預覽不能當作完整輸入或匯出 |
| Office 工作簿 | 檢查所選可見工作表及渲染錯誤，不支援的編輯使用原檔案 |
| TIFF | 先檢查選中頁和渲染結果，再解釋畫素或樣本值 |
| JSON | 格式重要時核對保留的源文字 |
| Markdown 表格 | 聚焦表格操作，使用鍵盤訪問複製、下載和全屏控制元件 |
提取 PDF 圖片與表格
需要從文獻 PDF 取得圖片或可複用表格時，使用此功能。先在文獻庫新增並檢查 PDF；只有文獻後設資料不能作為提取輸入。
- 開啟 PDF 預覽，選擇 Original PDF 旁的 Figures and tables。
- 首次使用時選擇 Download and continue，安裝所需模型資源，並等待安裝和完整性檢查。資源就緒後使用 Analyze PDF。
- 檢視逐頁進度。完成後選擇候選圖表，用 Show in PDF 對照原文頁面、圖注及周圍文字。
- 圖片可在影象預覽中使用 Copy image 或 Download image。表格選擇 Table，再選擇 TSV、HTML 或 Markdown，使用對應複製/下載操作；需要檢查原始裁圖時選擇 Image。
- 重新開啟匯出檔案，檢查行列對應、合併表頭、單位、腳註和跨頁內容，再用於分析或報告。
模型資源下載後，提取在本地執行。重新開啟同一 PDF 可以複用快取結果；需要重新提取時使用 Analyze again。需要停止時使用進度中的取消控制元件。分析未完成時，先檢查失敗頁提示，不要把當前可見候選項當作整篇文件的全部圖表。
Unplaced table text 和 Table notes 保留需要人工核對的內容。結構化單元格不可用時，對照原始裁圖和 PDF，不要推測缺失單元格。此提取流程暫不支援掃描頁和旋轉頁；提取不可用不等於 PDF 本身不能閱讀。
讓 Agent 讀取已提取的圖表
- 開啟目標 PDF，使用 Read with agent 將它連結到當前會話，並在 Figures and tables 完成相關頁面的分析。傳送問題前，確認輸入框中仍有該 PDF 的閱讀上下文。只有文獻庫記錄不等於已連結 PDF，連結本身也不會啟動這項分析。
- 提問時指明具體的圖、表或演算法，提供編號或頁碼，以及要回答的問題。
- 檢視工具活動：list_pdf_elements 列出可用的提取元素，read_pdf_element 讀取所選證據。要求回答標明來源頁碼，以及缺失或不確定的內容。
- 對照原圖或原表，核對表頭、單位和註釋。若尚未提取或結果不完整，先分析缺失頁面再重試；只有圖注不能證明趨勢或精確表值。
示例 要求讀取已連結論文的表格證據
從已連結 PDF 的提取元素中讀取 Table 1，報告物理 PDF 頁碼、列標題和與我的問題有關的數值。保留單位與腳註，明確說明缺失單元格或提取不完整的地方。
這些工具讀取已有提取結果，不會自行啟動 PDF 分析。表格可能分批返回，圖和演算法內容可能以圖片提供。需要圖片證據時，確認所選模型支援相應輸入；圖片已送達不等於已正確解讀。
主動載入遠端媒體
模型回覆引用的遠端圖片、音訊和影片，需要你主動載入。操作前閱讀控制元件顯示的目標主機。授權只針對當前媒體元素及其地址，不覆蓋所有後續回覆或整個域名；關閉預覽也不能撤回已經發出的請求。
含遠端圖片的 Mermaid 圖可能在載入前被阻止；需要時可要求生成不含嵌入圖片的普通圖。圖片傳送給模型時，Open-Science 會移除模型輸入副本的附加後設資料，原檔案保留。這不會移除圖片畫面中直接可見的敏感內容。
下載後核對原檔案
開啟目標預覽，選擇 Download，在系統儲存視窗確認檔名和位置，然後儲存。重新開啟下載副本，檢查內容。下載儲存的是原檔案；TIFF 翻到第二頁或 Excel 切換工作表不會把下載限制為當前頁或工作表。
預覽失敗時
先確認儲存成功，再核對版本和格式。嘗試下載，區分渲染器限制與檔案不可用。本地檔案在外部修改後，可用 Reload 重新讀取。不要為修復顯示而覆蓋輸入。排查時記錄檔名、型別、大小、應用版本和報錯，不必分享無關私有內容。
實現依據：Mermaid、PDF 條件、CSV、Office、TIFF。
專業格式的入口、控制元件和檔案要求見科學檢視器。