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Open-Science

Utilice Open-Science para organizar fuentes de investigación, trabajar con un agente, realizar análisis e inspeccionar resultados guardados.

Empieza aquí.

  1. Capacidades y insumos compatibles: Elija un camino para sus archivos o pregunta de investigación.
  2. Instalación y configuración por primera vez: preparar la aplicación, agente, modelo y tiempo de ejecución.
  3. Su primer proyecto y resultado: abrir una pequeña mesa de datos públicos y guardar un resumen comprobado.
  4. Permisos: inspeccionar las acciones solicitadas y gestionar el acceso recordado.
  5. Notebook y pruebas de ejecución: examinar el código, las variables y la procedencia del resultado.

Seguir una tarea de investigación real

ObjetivoCaminadResultado demostrado
Preparar una colección de lecturaConstruir una lista de lectura básicaTres documentos PRISMA revisados en la Biblioteca, una colección y un editor adjunto PDF
Revisar y resumir un conjunto de datosConvertir datos brutos en un análisis reproducibleControles de matriz de expresión de genes GSE60450, 12 muestreos QC CSV, informe de cifras y métodos de contabilidad en bruto

Actual GSE60450 RNA-seq figura y código de producto en Open-Science

Encontrar el nivel adecuado de detalle

SecciónLéalo para
GuíasControles de página, configuración y operaciones diarias
Flujos de investigaciónEscenarios de investigación con insumos, decisiones, entregables y comprobaciones de aceptación
Explorar herramientasFamilias de herramientas, servicios científicos y opciones de integración
SkillsMétodos reutilizables, el directorio y la gestión de paquetes
EspecialistasFunciones, capacidades asignadas, delegación y examen
ReferenceLimitaciones de salida, reglas de configuración, formatos de paquete, contratos CLI/API y Changelog

Utilice Search o XXXK / Ctrl+K para buscar los títulos, títulos y texto corporal de esta documentación. La propia búsqueda de la aplicación tiene un alcance diferente.

Antes de ejecutar un ejemplo

Los caminantes locales utilizan papeles PRISMA públicos y la matriz GSE60450 RNA-seq. Descargue las entradas enlazadas y confirme el modelo, el tiempo de ejecución y los permisos requeridos por cada tarea.

Computación remota incluye un análisis Direct SSH RNA-seq, la colección de salida, la recuperación de reiniciar y la cancelación. Slurm terminal monitoring needs working accounting; La inferencia GPU necesita un entorno de software compatible.

Utilice Referencia para límites técnicos y configuración, y Cambio para la historia de la liberación.