Períodos de sesiones y ramas

A project groups related sources and work. Una sesión es una conversación dentro de ella. Utilice una nueva sesión para una pregunta separada, y una rama cuando la nueva pregunta debe conservar un historial de conversación seleccionado. Tampoco es un reemplazo para comprobar qué archivos y la ejecución registran la nueva conversación en realidad puede acceder.

Crear, nombrar y volver a una sesión

Abra el proyecto, seleccione New bajo Sesiones, escriba una solicitud y envíela. Verifique el nombre del proyecto primero: una nueva sesión pertenece a ese proyecto. Seleccione una fila de sesión para volver a ella; leer su estado antes de asumir que la tarea ha terminado.

Ejemplo Name an RNA-seq quality-check session

Para la ejecución GSE60450 completada, usamos Edit… para guardar esta información:

Campo	Valor de ejemplo	Constraint
Título	RNA-seq count matrix - validation and sample QC	hasta caracteres 80; el editor muestra el conteo
Descripción	Validate the public GSE60450 matrix and retain descriptive QC outputs with source integrity checks.	Hasta caracteres 1,000
Guardar	Persiste los cambios	Revisa el título de la barra lateral después de cerrar
Cancelar / Cerrar	Salir sin aplicar el borrador	Esto no cancela la investigación

Elija Pin del menú de filas para mantener la sesión en el grupo Pinned. Unpin lo devuelve a la lista ordinaria. Pinning organiza el acceso; no mantiene un núcleo vivo o protege una sesión de la eliminación.

Durante una sesión para comprobar su número, así como su título y proyecto. El número ayuda a distinguir conversaciones similares; confirmar la fila seleccionada antes de editar o borrarla.

Guardar un marcador de lectura

Utilice marcadores privados de lectura para guardar un pasaje o región PDF con una nota, y luego volver a él desde Bookmarks en esta sesión. Salvar un marcador no envía el pasaje al agente.

Lea el menú de sesión correctamente

Medidas comunes en el encabezado del período de sesiones

Abierto Session actions junto al título de sesión actual para Edit…, Pin / Unpin, New side chat, Fork, Export y Archive. Confirme el nombre y número de sesión mostrados antes de elegir una acción.

El submenú Export separa la conversación, el paquete de investigación .science y las exportaciones de diagnóstico. Una conversación es una copia de lectura, un paquete entrega registros de investigación guardados, y el diagnóstico admite la solución de problemas. La evidencia diagnóstica sensible requiere confirmación separada; la exportación sigue siendo local hasta que la compartan. Inspeccione su contenido primero.

Las acciones indisponibles son deshabilitadas para el estado actual. Una sesión de importación de sólo lectura necesita Fork antes de que pueda continuar la ejecución; ver Side Chat para el alcance de la discusión separada. El menú de inicio de sesión de la barra lateral también proporciona View replay, View notebook y descargas de archivos. La imagen de abajo muestra ese menú de la barra lateral.

Medida	Resultado	Check
Editar…	Cambiar el título/descripción	Correcta fila y etiqueta guardada
Descargar todos los artefactos	Abrir una selección de artefactos / flujo de descarga	Esta sesión guarda archivos y solicita selección
Ver Notebook	Abrir la vista de ejecución de la sesión	Propietario, idioma y carreras reales
Exportar conversación…	Exportar la conversación a través del formato ofrecido/opciones	La exportación de la transcripción es distinta de un paquete de artefacto/Notebook
Archivo	Ocultar la sesión de navegación activa	Queda recuperable en Ajustes → Archivado
Eliminar	Abra una confirmación de eliminación permanente	Lea exactamente qué datos se afectan; Cancela las conservas

Branch after a completed result

Ejemplo práctico Subdivisión una sesión completa de CQ para la anotación de muestras

Supongamos que desea discutir la anotación de la muestra aguas abajo mientras mantiene intacta la conversación QC de la cuenta cruda.

1. Abra la respuesta completa en el período de sesiones original.
2. Seleccione Branch in new session debajo de esa respuesta.
3. Confirme una nueva fila de sesión aparece. Inicialmente puede compartir el título original.
4. Renombrarlo a GSE60450 - follow-up interpretation con Edit….
5. Inspeccione la transcripción heredada antes de presentar la siguiente solicitud. Referencia de los artefactos originales del proyecto explícitamente cuando sea necesario.

Una rama conserva la historia de la conversación seleccionada, pero no recrea el núcleo vivo original. Para una actividad copiada etiquetada code shown o un enlace histórico bloqueado, abra el artefacto original del panel Archivos del proyecto e inspeccione su sesión de producción.

La disponibilidad de sucursales depende del estado del mensaje y del marco. Side Chat está separado. Una nueva discusión lateral hereda el modelo actual de esta conversación y el esfuerzo de razonamiento; puede seleccionar un modelo diferente para su próximo envío.

Revise un mensaje anterior

Edit message en una solicitud de usuario anterior crea una revisión de mensaje, en lugar de borrar toda la historia. Lea el texto revisado y los adjuntos antes de presentarlo. Use Anterior/Siguiente revisión del mensaje donde esté disponible para inspeccionar alternativas. El contexto visible posterior depende del camino seleccionado; una respuesta vieja no debe ser tratada como la respuesta a una solicitud recién editada.

Ejemplo práctico Revise una solicitud de definiciones métricas de QC

Para este ejemplo de QC, elija Edit message en la pregunta completada, reemplace la solicitud de un consentimiento con cuatro definiciones, y elija Send. Los controles de revisión no están disponibles mientras se está ejecutando la nueva respuesta. Una vez que termine, Previous message revision vuelve a 1/2 con la pregunta y respuesta originales; Next message revision vuelve a la respuesta revisada. Otra corrección a los nombres exactos de campo CSV produjo 3/3. En esta sesión de suscripción de Codex, los dos informes guardados antes de que el mensaje revisado permaneciera disponible y sus bytes descargados no se cambiaron.

La misma vía de revisión también se ejecutó con OpenCode y un modelo local: la solicitud revisada produjo la nueva frase, Anterior restableció la respuesta original, y Next restauró la respuesta revisada. Este solo ejemplo de conexión no establece que el estado de la herramienta o los efectos secundarios externos se invierten.

Cancel deja sin enviar la edición. Send solicita una nueva respuesta; compruébalo antes de continuar. Use un seguimiento para corregir la siguiente acción o una rama para una investigación por separado.

Paquetes de investigación

Para entregar las ramas de conversación, archivos y pruebas juntos, utilice un Paquete de investigación .science. La guía cubre las opciones de exportación, importación e inspección, sesiones de sólo lectura y recuperación de transferencia.

Exportar conversaciones y archivos de investigación

Elija Export → Export conversation… en el menú de la fila de sesión para compartir una discusión de investigación. Primero usa Edit… para dar a la sesión un título conciso: la exportación PDF utiliza ese título, y un título automático largo puede consumir gran parte de la primera página.

Control	Medidas y resultados
Formato → PDF / Markdown	PDF para lectura e impresión; Markdown para la edición posterior
Conversación completa	Exportar la actual rama de conversación
Seleccionado	Mostrar las casillas de verificación de giro, inicialmente vacías; el contador sigue su selección
Seleccionar todo	Seleccione cada turno de lista
Exportar PDF / Exportar Markdown	Abra el diálogo de ahorro del sistema; no disponible cuando no se seleccionan turnos
Cancelar	Cerrar sin crear una exportación

Ejemplo práctico Exportar sólo las definiciones finales GSE60450 QC turn

En GSE60450 — Methods and claim audit, la selección de la vuelta final produjo un PDF de una página con sólo esa petición y sus cuatro definiciones métricas. La discusión anterior estaba ausente. El PDF de conversación completa también fue reabierto y comprobado. La exportación de marcación de vuelta seleccionada anterior comenzó con su seguimiento seleccionado. Un giro puede contener varios mensajes auxiliares, por lo que seleccionar un turno no necesita exportar exactamente dos mensajes.

La exportación de conversación no sustituye la descarga del archivo de investigación. Los enlaces de resultados pueden referirse a los registros de aplicaciones internos que un destinatario no puede abrir. Descargue el CSV, figuras o informes por separado cuando estos archivos son parte de la entrega.

Descargar artefactos de sesión

Elija Download all artifacts, seleccione los archivos, elija Descargar artefactos N, y elija una carpeta de destino. Esta entrada guarda archivos separados. Los dos métodos descargados y los archivos de Markdown de claim-audit fueron reabiertos y coincidieron con sus artefactos guardados byte for byte.

Descargar un paquete de archivo de proyecto

Abra el menú de nombre de proyecto en la parte superior izquierda → Download artifacts…. Los archivos se agrupan bajo Generated y Uploads. Todos se seleccionan inicialmente; use Uncheck all, elija los archivos para entregar, y guarde el ZIP.

Elija Cancel en el sistema ahorre diálogo para abandonar que ahorra; su selección de archivos sigue disponible. Una vez que la escritura comienza, la aplicación desactiva la cancelación y el cierre. Esperar el resultado; cancelar el diálogo de destino es diferente de detener una escritura en progreso.

Si sólo algunos archivos descargados, restaurar el acceso a los archivos fuente no disponibles, entonces seleccione la entrega completa y descargar de nuevo. Salvar al mismo nombre ZIP reemplaza el archivo anterior. Seleccionar sólo archivos fallidos crea un nuevo paquete que contiene sólo esos archivos; no los anexa al ZIP anterior.

Abra el ZIP descargado y compare los conteos de archivos, nombres y contenidos bajo generated/ y uploads/ con su selección antes de compartir. Este paquete no es una copia de seguridad del proyecto completo, historia de conversaciones, núcleo Notebook o tiempo de ejecución.

Archivo y restauración de una rama terminada

Elija Archive en la rama prevista, luego abra Settings → Archived → Sessions. Compruebe el tiempo de proyecto y archivo antes de seleccionar Restore. Confirme que la rama vuelve a la navegación activa y su contenido guardado abierto; la conversación original es separada.

Para un proyecto archivado, utilice su entrada Manage e inspeccione las sesiones del proyecto. Ver Almacenamiento y trabajos archivados para la diferencia entre archivo, restauración, eliminación y reubicación de almacenamiento. La desaparición de una sesión de la lista activa no es evidencia de que el espacio de disco fue reclamado.

Fuentes: editor de sesión, ejecución del espacio de trabajo.

Preparar un período de sesiones en curso

Utilice Fork cuando necesite una copia de trabajo independiente de una sesión local o importada. Branch in new session comienza a partir de un mensaje seleccionado; Fork copia el historial completo de investigación guardado de la sesión, incluyendo sus ramas, registros Notebook, versiones de archivos, literatura, anotaciones y marcadores privados. La sesión de origen permanece inalterada. Copiar un registro no lo reimprime o establece que su entorno está listo en este ordenador.

1. En la aplicación de escritorio, termine o pare la tarea actual. Espere a que cualquier transferencia de paquetes termine.
2. Abra las acciones de la fila de sesión y elija Fork. La aplicación muestra los progresos en la transferencia; Run in background esconde esa ventana sin cancelarla.
3. Espera a Fork completed y abre la nueva sesión. Abra su título para inspeccionar Source session y el nuevo número de sesión.
4. Abra un archivo heredado y compruebe su contenido. Inspeccione el modelo seleccionado y el tiempo de ejecución antes de continuar; viejos caminos o permisos de la máquina pueden necesitar atención.
5. Envíe la siguiente tarea en la copia y compruebe su nueva salida. Mantenga el original como el registro de referencia.

Fork está disponible en la aplicación de escritorio. Las sesiones importadas permanecen solos hasta que trabajes en su tenedor. Los ajustes del proyecto y la memoria no son un proyecto copiado separado. Los registros antiguos de revisión o verificación describen sus versiones registradas; inspeccionar cualquier estado anticuado antes de tratarlos como cheques actuales.

Continuar un cálculo de QC en la copia

Ejemplo práctico Presione una sesión local en v0.31.1

En el proyecto GSE60450, marque la sesión QC existente y abra el gse60450-qc-summary.csv. Compruebe las muestras 12 y las cuentas totales de 269,027,617 en bruto. En la copia, pida al agente que lea ese archivo con Python, verifique ambos valores, calcule los promedios por muestra y guarde un fork-qc-check.csv. El resultado es 22,418,968.083333…. La fuente y los archivos heredados tienen contenidos idénticos; el nuevo cálculo es un archivo separado. Esto significa que demuestra la continuación, no la normalización de la expresión.

Descarga el resultado calculado. Para continuar con un paquete .science recibido, siga Paquetes de investigación.

Lea la tarjeta de información de sesión

Seleccione el título de sesión para ver su número, descripción, fuente, tiempos de creación/actualización, recuento de mensajes para el recuento actual de rama y artefacto. Utilice Pin para mantener la sesión fácil de encontrar, o Editar sesión para cambiar su título y descripción. Un separador Continuación de una conversación se vincula de nuevo a la fuente registrada.

Diagnóstico de la sesión de exportación

Utilice Session actions → Export → Export diagnostics… en el encabezado, o el submenú Export correspondiente en la fila de sesión, para recoger fuentes de diagnóstico seleccionadas en un archivo local. Los registros de aplicaciones pueden incluir metadatos fuera de la sesión seleccionada. Revise la lista de fuentes, el mensaje de terminación y el contenido de archivo antes de compartir; ver Medidas de exportación de diagnóstico.

Replay o discuta el trabajo grabado

Elija View replay del menú de filas de sesión para pasar por la conversación grabada, la actividad Notebook y las versiones de archivos guardadas. Discuss inicia una conversación separada vinculada a esa investigación. Las sesiones importadas también exponen ambas acciones al lado de su solo aviso de lectura. Siga Repetición de sesión para la reproducción, inspección de fuentes y una discusión trabajada.

Continuar después de cambiar el agente o reconectar

Antes de enviar el siguiente turno, compruebe el agente/Specialist seleccionado y el modelo. v1.0.0 restaura las conversaciones ACP con el agente seleccionado y repara la continuación Codex despreocupada después de los interruptores Specialist. Reabrir la conversación original e inspeccionar sus mensajes guardados más recientes y ejecutar estado después de la reconexión. No reenviar una escritura simplemente porque su respuesta fue interrumpida; confirmar si se completó primero. Cambiar un agente o recuperar una conexión no es evidencia de que un análisis fallido anterior tuvo éxito.

Reconozca una sesión esperando por usted

Una sesión parada para su respuesta o aprobación muestra un estado de espera en el hogar, en la barra lateral y en la conversación. Abra la tarjeta pendiente, lea la decisión solicitada y envíela para continuar. Recargar la aplicación no responde por sí misma a la pregunta o aprueba una herramienta. Haga doble clic en una sesión en la barra lateral del espacio de trabajo para abrir su editor.

Para las exportaciones de diagnóstico, lea el resumen de la terminación: una exportación parcial es una advertencia, no un paquete de diagnóstico completo. Mantenga el error específico y revise los archivos exportados antes de compartirlos.

Ampliar una conversación compacta

En v1.0.4, los cambios completados colapsan mensajes intermedios y la actividad de la herramienta de grupo en resúmenes. Ampliar un grupo para inspeccionar sus detalles; correr, esperar y interrumpir el trabajo sigue siendo visible. Búsqueda de conversación, anotaciones y hallazgos nativos revelan contenido oculto coincidente. Presentación de cambios de fusión, no el registro de investigación guardado o si una tarea completada.