Open-Science

Open-Scienceを使用して、研究ソースを整理し、エージェントと連携し、分析を実行し、保存した結果を検査します。

はじめに

1. 能力とサポートされた入力:ファイルや研究の質問のパスを選択します。
2. 導入事例と初回設定:アプリ、エージェント、モデル、ランタイムを用意します。
3. 最初のプロジェクトと結果:小さなパブリックデータテーブルを開き、チェックされた要約を保存します。
4. 権限:要求された行動を点検し、記憶されたアクセスを管理して下さい。
5. Notebookと実行証拠:コード、変数および結果の証明を調べて下さい。

実際の研究タスクに従う

ゴール	ウォークスルー	実証結果
読書コレクションの準備	コア読書リストを作成する	ライブラリ、コレクション、および添付パブリッシャーPDFでレビューされた3つのPRISMA論文
データセットの確認と要約	生データを再現可能な分析に変える	GSE60450 遺伝子発現行列チェック, 12-sample QC CSV, 生計算図と方法報告

細部の正しいレベルを見つける

セクション	それを読む
ガイド	ページ管理、設定、日常業務
研究ワークフロー	インプット、決定、成果物、受入チェックによる研究シナリオ
ツールを探す	ツールファミリー、科学サービス、統合選択
Skills	再使用可能な方法、ディレクトリおよびパッケージ管理
スペシャリスト	役割、割り当てられた機能、委任およびレビュー
Reference	正確な制限、設定ルール、パッケージ形式、CLI/API契約および変更ログ

Search または ⌘K / Ctrl+K を使用して、このドキュメントのタイトル、見出し、および本文のテキストを検索します。 アプリケーション独自の検索には、異なるスコープがあります。

例を実行する前に

ローカルウォークスルーは、パブリックPRISMA紙とGSE60450 RNA-seqマトリックスを使用します。 リンクされた入力をダウンロードし、各タスクで必要なモデル、ランタイム、権限を確認します。

遠隔計算は、完成したDirect SSH RNA-seq分析、出力コレクション、回復を再起動し、キャンセルを含みます。 Slurmターミナル監視は働く経理を必要とします; GPU 推論は、互換性のあるソフトウェア環境を必要とします。

リファレンスは、技術限界と構成、リリース履歴の変更履歴に使用します。