Повторить и обсудить записанную сессию

Воспроизведение сеанса представляет сообщения, шаги инструмента и версии файлов, сохраненные в сеансе. Используйте его, чтобы следить за анализом, найти его доказательства и задать сфокусированный вопрос. Воспроизведение не повторяет код или не устанавливает воспроизводимость анализа; Используйте Проверка воспроизводимости для этой задачи.

Откройте повтор

1. Откройте меню действий сессии на боковой панели и выберите View replay. Для импортированной сессии .science панель Imported research history также предоставляет View replay.
2. Проверьте название сессии и филиал. Когда предлагается Replay branch, выберите ветку, которую вы собираетесь проверить.
3. Используйте Enter full screen для большего пространства. Exit full screen возвращается в рабочее пространство Закрытие предварительного просмотра не удаляет сеанс.

Импортные исследования остаются только для чтения. Вы можете осмотреть и обсудить его; Выберите Fork to continue, если вам нужно продолжение. Следуйте за импорт исследовательского пакета, прежде чем открывать его повтор.

Следуйте за записанными шагами

Контроль	Меры
Play replay / Pause replay	Начать или приостановить представление сохраненной последовательности
Previous step / Next step	Перейти на соседний зарегистрированный шаг
Replay progress	Ищите другую точку в записи
Playback speed	Изменить скорость презентации; Это не ускоряет вычисления
Browse steps	Выберите сообщение, шаг инструмента или событие файловой версии по его метки
Notebook / View files	Проверить записанный материал или список файлов Notebook, доступный на этом этапе.
Watch again	Перезагрузка после того, как воспроизведение завершено

Расширить карту инструмента для чтения его сохраненных входов и выходов. Проверяйте имена файлов и номера версий перед использованием результата. Позиция повтора сохраняется для возвращения к той же записи. Более старые сессии могут показывать временную шкалу, восстановленную из архивных записей; Его продолжительность представления не является эталоном исходного вычисления.

Практический пример Обсудите доказательства в анализе пути TP53

Этот пример открывает записанный Анализ Pathway Commons, который выбрал Reactome Транскрипционное регулирование TP53. Его экспорт содержит записи взаимодействия 3,318 и узлы 387. Это результаты этого сохраненного анализа, не стоит ожидать от каждого будущего запроса.

В Browse steps можно найти экспортируемую сеть, оригинальные ответы, исследовательскую записку и небольшую таблицу взаимодействия TP53-MDM2-CDKN1A. В примере 12 записаны шаги. Выберите этап файловой версии таблицы, а затем прочитайте предыдущее объяснение объема сети.

Спросите о шаге

1. Остановитесь на соответствующем шаге и выберите Ask about this step. Для более широкого обсуждения используйте Ask about this research в заголовке.
2. В Ask in a conversation, выберите письменный разговор или New conversation. - действие добавляет контекст к проекту; Он не ставит вопрос сам по себе.
3. Проверьте вложение Discuss и его метки сессии / шага. Введите свой вопрос, выберите подключенную модель и выберите Send. В примере используется Codex subscription.
4. Если требуется одобрение инструмента, проверьте предлагаемый доступ, прежде чем разрешить необходимую операцию. Затем сравните ответ с сохраненными доказательствами и их исходным контекстом.

From the recorded TP53 pathway analysis, explain why the missing direct
TP53–CDKN1A edge does not show that regulation is absent. Identify the
saved evidence and separate the recorded result from a new biological
claim. Keep the response in English.

Ответ идентифицирует tp53_mdm2_cdkn1a_readable_interactions.tsv и отличает то, что содержит сплющенный экспорт, от биологического заключения. Он указывает на выбранный исходный сеанс, ветвь и шаг. Прочитайте этот источник еще раз, прежде чем принять интерпретацию. Связанная запись не делает каждую модель правильной.

Когда доказательства недоступны

Записанный вызов инструмента может оставаться видимым даже тогда, когда его исходная среда исполнения недоступна. Прочитайте сохраненный код и выход; Не рассматривайте предупреждение о вреде окружающей среды как новый результат.

Если файл сообщает о Предпросмотр недоступен или The recorded evidence is unavailable, проверьте исходную файловую карту сеанса и выбранную версию. Если эта точка зрения также не может открыть его, используйте отдельно сохраненный оригинальный файл или получите полный пакет исследований от его автора. Имя файла и завершенная временная шкала воспроизведения не доказывают, что содержимое файла доступно. Обсудите только те доказательства, которые вы можете проверить.

Для нового вычисления форк сессии поставляет необходимые файлы / среду и запускает анализ. Чтобы сравнить новый запуск с сохраненным артефактом, используйте Проверка воспроизводимости, а не индикатор Completed.